De smaak van bonenkruid is overheersend, kruidig en peperachtig. De eenjarige soort is wat minder pikant. Bonenkruid geeft smaak aan de naam zegt het al bonengerechten.
Verder wordt het in de keuken ook wel in soepen, goulash en komkommersalade gedaan.
Men gebruikt het om forel, salami, mierikswortelsaus, bitters en versterkende wijn smaak te geven.